脱氧核苷酸(妇科检查脱氧核糖核酸)
嘧啶核苷酸的从头合成就是合成UMP,然后从UMP衍生出CMP和dTMP。嘧啶环比较简单,所以合成步骤少,没有分支。相对来说,在嘌呤环合成过程中,组氨酸的合成和AICAR的释放可以看作是一个分支。
UMP合成途径。引自《医学生物化学》杂志
两种常见的分子用于合成UMP:氨基甲酰磷酸(CP)和磷酸核糖焦磷酸(PRPP)。前者是尿素合成的中间体,后者参与嘌呤、组氨酸和色氨酸的合成。不过,这两种分子的用途和以前略有不同。
PRPP是嘌呤合成中最初的“载体”,整个嘌呤环都是在磷酸核糖上合成的。但在UMP的合成中,后期加入了磷酸核糖,嘧啶环的合成从CP开始。这里催化CP合成的酶是氨甲酰磷酸合酶2(CPS-2),它位于细胞质中。尿素循环中的CPS-1位于线粒体中。
细胞质中氨甲酰磷酸的合成。引自《医学生物化学》杂志
CPS2催化谷氨酰胺和碳酸氢盐形成氨甲酰磷酸,消耗两个ATP。与CPS1相比,直接消耗相同,但CPS1的底物是氨。因为谷氨酰胺的合成也需要消耗ATP,所以这个反应消耗更多。其优点在于摆脱了对氨的依赖,可以在氨浓度较低的细胞质中进行。
对于人体来说,两个CP还有一个区别:CPS1是一个独立的蛋白质,而CPS2是一个三功能蛋白质CAD的一部分。CAD将催化这一途径前三步的酶活性整合成一个肽链,肽链包括CPSase、ATCase(天冬氨酸转氨酶)和DHOase(二氢乳清酸酶),所以称为CAD。
人类冠心病的基因结构和反应机制。引自结构。2016年7月6日;24(7):1081-94.
这种多酶融合可以提高催化效率,也是一种进化趋势。哺乳动物的脂肪酸合酶(FAS)也是如此。对于原核生物中的ATCase活性,一些生物是单独催化亚单位的三聚体,而另一些生物具有调节亚单位或与DHOase结合。
不同原核生物的ATCase结构。引自结构。2016年7月6日;24(7):1081-94.
ATCase活性催化氨甲酰磷酸与天冬氨酸(氨甲酰磷酸可视为氨甲酰基的活性形式)反应生成氨甲酰天冬氨酸。PALA(N-膦酰基乙酰-L-天冬氨酸)是ATCase过渡态的类似物,因此可以抑制CAD,是一种抗肿瘤药物。
DHOase的活性是催化氨甲酰天冬氨酸(CA)两端的羧基和氨基反应生成闭环二氢乳清酸(DHO)。DHO被二氢乳清酸脱氢酶脱氢生成乳清酸盐。乳清酸与PRPP反应形成乳清肌苷酸(OMP),其脱羧形成UMP。
后两个反应也由双功能酶催化,该酶的N-末端结构域具有乳清酸磷酸核糖转移酶活性,C-末端具有OMP脱羧酶活性,称为UMP合成酶(UMPS)。
尿苷胺化可以产生胞嘧啶,但这个反应只能在NTP水平上进行。因此,UMP首先与两分子ATP反应生成UTP,然后在CTP合成酶(CTPS)的催化下与谷氨酰胺和ATP反应生成CTP。
CTP的合成引自《医学生物化学》杂志
DNA合成所需的脱氧核苷酸是通过还原相应的核糖核苷二磷酸,即还原NDP生成dNDP得到的。催化这一反应的核糖核苷酸还原酶(RNR)是DNA合成和修复的关键酶,在调节DNA合成的总体速率方面起着关键作用。
RNR是由自由基机理催化的,根据产生自由基的方式可分为三种类型。之一类来自酪氨酸残基,第二类来自腺苷钴胺,第三类来自糖基。RN被催化后,RN的关键巯基形成二硫键,需要还原成游离巯基。最终电子供体都是NADPH,但中间电子传递有两个系统,即硫氧还蛋白系统(TRX)和谷氧还蛋白系统(GRX)。目前推测两个系统可以互为备份(World J Biol Chem。2014年2月26日;5(1): 68–74.)。
核糖核苷酸还原酶系统。引自《医学生物化学》杂志
DNA所需的胸腺嘧啶由尿嘧啶甲基化产生,甲基化在dUMP上进行。该反应由胸腺嘧啶核苷酸合成酶(TYMS)催化,以甲基四氢叶酸为甲基供体,生成dTMP。甲基化的四氢叶酸(THF)产生二氢叶酸(DHF),需要二氢叶酸还原酶(DHFR)再生。可以通过UDP还原、dCMP的脱磷或脱氨来产生DUMP。
dTMP的合成引自《医学生物化学》杂志
嘧啶核苷酸合成也有补救 *** 。尿嘧啶可以与PRPP或尿苷与1-磷酸核糖形成UMP,然后被尿苷激酶催化形成UMP。胞嘧啶不能与PRPP反应,但胞苷可以被尿苷激酶催化生成CMP。脱氧核糖-1-磷酸可以通过磷酸化酶合成脱氧核糖核苷,然后通过脱氧核糖核苷激酶生成脱氧核苷酸。
有些辅酶也属于核苷酸衍生物。NAD的合成是烟酸与PRPP反应生成烟酸单核苷酸,再与ATP缩合生成烟酸腺嘌呤二核苷酸,最后由谷氨酰胺生成NAD。NAD激酶可以催化它产生NADP。
在FAD的合成中,叶黄素先与ATP反应生成黄素单核苷酸(FMN),再与ATP反应生成FAD。CoA的合成是泛酸与ATP反应生成4-磷酸泛酸,然后与半胱氨酸缩合脱羧生成4-磷酸泛酸巯基乙胺,再与ATP缩合生成去磷酸化CoA,最后被ATP磷酸化为CoA。